Il percorso dei tratturi e le aree di insediamento pastorale sono segnati dalla presenza diffusa di chiese e cappelle. I luoghi sacri più importanti del mondo pastorale sono i grandi santuari, meta di pellegrinaggi rituali annuali: il santuario della Madonna dell’Incoronata nei dintorni di Foggia e la grotta-santuario dell’Arcangelo Michele a Monte Sant’Angelo sul Gargano. Le chiese dei paesi traversati dalla transumanza e quelle collocate nei luoghi di sosta assicurano un’assistenza spirituale costante ai pastori, grazie a un clero e a ordini religiosi specializzati. Va infine segnalata la sequenza delle cappelle, officiate solo in occasioni particolari e nelle festività patronali, spesso integrate a insediamenti pastorali e a rifugi di fortuna. In prossimità di chiese e cappelle si svolgevano feste rituali e piccole fiere durante l’anno e nei periodi della transumanza.